Деградация многолетней мерзлоты в результате климатических изменений представляет собой серьёзную проблему для Арктики. Оттаивание вечной мерзлоты снижает несущую способность фундаментов зданий и объектов инфраструктуры в населённых пунктах, расположенных на многолетнем льду. Специалисты «Арктического Плавучего Университета» ведут наблюдение за состоянием мерзлоты, в том числе с помощью криоскважины на острове Хейса. Руководитель экспедиции «Арктический Плавучий Университет», директор Института стратегического развития Арктики САФУ Александр Сабуров отметил, что деградация многолетней мерзлоты на фоне климатических изменений — серьёзный вызов для региона, особенно для городов, возвышающихся на этих грунтах. В ходе экспедиций Арктического плавучего университета на борту научно-исследовательского судна «Профессор Молчанов» учёные изучают, в том числе, влияние изменения климата на арктические территории. Среди климатических и экологических угроз исследователи выделяют таяние, или, научным термином, деградацию многолетней мерзлоты; ранее её называли вечной, но, по мнению специалистов, это определение устарело.